تم تأسيس قسم علم الحاسوب في عام 1985 في كلية العلوم، حيث كان البرنامج قبل ذلك جزءا من قسم الرياضيات. وفي عام 1995 أطلق القسم برنامجي البكالوريوس والماجستير في علوم الحاسوب (مسار الرسالة والامتحان شامل). وتم إلحاق القسم بكلية الملك عبدالله الثاني لتكنولوجيا المعلومات بعد إنشائها في عام 2000.

ويساهم القسم من خلال أعضاء هيئة التدريس فيه ومن خلال الطلبة الذين يتخرجون منه في تطوير قطاع تكنولوجيا المعلومات في الأردن، كما يساهم في تقديم الخدمات الاستشارية في مجال تكنولوجيا المعلومات للجامعة الأردنية وللمجتمع المحلي، فضلاً عن المساهمات الاخرى في المجال البحثي محلياً وعالمياً.